Bayesian inversion in biomedical imaging

Biomedizinische Bildgebung ist zu einer Schlüsseltechnik geworden, Struktur oder Funktion lebender Organismen nicht-invasiv zu untersuchen. Relevante Informationen aus den gemessenen Daten zu rekonstruieren erfordert neben mathematischer Modellierung und numerischer Simulation das verlässliche Lösen...

Author: Lucka, Felix
Further contributors: Burger, Martin (Thesis advisor)
Division/Institute:FB 10: Mathematik und Informatik
Document types:Doctoral thesis
Media types:Text
Publication date:2015
Date of publication on miami:09.02.2015
Modification date:27.07.2015
Edition statement:[Electronic ed.]
Subjects:Bayesianische Statistik, Biomedizinische Bildgebung, inverse Probleme, Sparsity, Computertomographie, Elektroenzephalographie, Magnetoenzephalographie Bayesian inference; biomedical imaging; inverse problems; sparsity; computed tomography; electroencephalography; magnetoencephalography
DDC Subject:510: Mathematik
License:InC 1.0
Language:English
Format:PDF document
URN:urn:nbn:de:hbz:6-80359613770
Permalink:https://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:hbz:6-80359613770
Digital documents:diss_lucka.pdf

Biomedizinische Bildgebung ist zu einer Schlüsseltechnik geworden, Struktur oder Funktion lebender Organismen nicht-invasiv zu untersuchen. Relevante Informationen aus den gemessenen Daten zu rekonstruieren erfordert neben mathematischer Modellierung und numerischer Simulation das verlässliche Lösen schlecht gestellter inverser Probleme. Um dies zu erreichen müssen zusätzliche a-priori Informationen über die zu rekonstruierende Größe formuliert und in die algorithmischen Lösungsverfahren einbezogen werden. Bayesianische Invertierung ist eine spezielle mathematische Methodik dies zu tun. Die vorliegende Arbeit entwickelt eine aktuelle Übersicht Bayesianischer Invertierung und demonstriert die vorgestellten Konzepte und Algorithmen in verschiedenen numerischen Studien, darunter anspruchsvolle Anwendungen aus der biomedizinischen Bildgebung mit experimentellen Daten. Ein Schwerpunkt liegt dabei auf der Verwendung von Dünnbesetztheit/Sparsity als a-priori Information.

Biomedical imaging techniques became a key technology to assess the structure or function of living organisms in a non-invasive way. Besides innovations in the instrumentation, the development of new and improved methods for processing and analysis of the measured data has become a vital field of research. Building on traditional signal processing, this area nowadays also comprises mathematical modeling, numerical simulation and inverse problems. The latter describes the reconstruction of quantities of interest from measured data and a given generative model. Unfortunately, most inverse problems are ill-posed, which means that a robust and reliable reconstruction is not possible unless additional a-priori information on the quantity of interest is incorporated into the solution method. Bayesian inversion is a mathematical methodology to formulate and employ a-priori information in computational schemes to solve the inverse problem. This thesis develops a recent overview on Bayesian inversion and exemplifies the presented concepts and algorithms in various numerical studies including challenging biomedical imaging applications with experimental data. A particular focus is on using sparsity as a-priori information within the Bayesian framework.