Phylogenetischer Vergleich von chromosomal- und plasmid-kodierten Genabschnitten in enterohämorrhagischen Escherichia coli

In einem repräsentativen Kollektiv HUS-assoziierter EHEC wurde untersucht, in welchem Verhältnis sich das Plasmid und das Chromosom zueinander entwickelt haben. Dazu wurden 41 Stämme hinsichtlich der plasmid-kodierten Gene EHEC-hlyA und espP untersucht und sequenziert. Diese plasmidalen Sequenzen so...

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Verfasser: Waldmann, Karsten
Weitere Beteiligte: Mellmann, Alexander (Gutachter)
FB/Einrichtung:FB 05: Medizinische Fakultät
Dokumenttypen:Dissertation/Habilitation
Medientypen:Text
Publikation in MIAMI:17.04.2014
Datum der letzten Änderung:27.07.2015
Angaben zur Ausgabe:[Electronic ed.]
Schlagwörter:Escherichia coli; EHEC-hlyA; espP; Chromosom; Plasmid; Phylogenie
Fachgebiet (DDC):610: Medizin und Gesundheit
Lizenz:InC 1.0
Sprache:Deutsch
Format:PDF-Dokument
URN:urn:nbn:de:hbz:6-73359418156
Permalink:https://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:hbz:6-73359418156
Onlinezugriff:diss_waldmann.pdf
Inhaltsverzeichnis:
  • 1. Einleitung ........................................................................ 1
  • 2. Material und Methoden ................................................... 6
  • 2.1. Materialien............................................................................6
  • 2.1.1. Standardgeräte, -chemikalien und -materialien............................. 6
  • 2.1.2. PCR-Reagenzien.......................................................................... 6
  • 2.1.3. Stammsammlung und Referenzstämme ....................................... 7
  • 2.2. Methoden .............................................................................9
  • 2.2.1. Polymerase Kettenreaktion (PCR) ................................................ 9
  • 2.2.2. Sequenzierung der PCR-Produkte.............................................. 10
  • 2.2.3. Phylogenetische Analysen .......................................................... 11
  • 2.2.4. Vergleich der phylogenetischen Bäume...................................... 11
  • 3. Ergebnisse.................................................................... 13
  • 3.1. Nachweis von espP und EHEC-hlyA in den
  • HUSEC-Stämmen .............................................................. 13
  • 3.2. Phylogenie der einzelnen Gene.......................................... 15
  • 3.3. Vergleich der phylogenetischen Bäume.............................. 19
  • 4. Diskussion..................................................................... 22
  • 5. Literaturverzeichnis....................................................... 28
  • .

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