Erweiterte Suche

Charakterisierung von nosokomial und ambulant erworbenen Methicillin-resistenten Staphylococcus-aureus-Stämmen aus Deutschland, 2010 - 2011

Die typischerweise nosokomial erworbenen Methicillin-resistenten Staphylococcus aureus-Stämme (HA-MRSA) breiten sich zunehmend auch im ambulanten Sektor (CA-MRSA) und bei Personen mit Nutztier-Kontakt (LA-MRSA) aus. Diese Studie untersucht die Epidemiologie und genetischen Hintergründe der MRSA-Population in Deutschland im Jahr 2010. Es nahmen 33 mikrobiologische Zentren mit bis zu 50 konsekutiv gesammelten MRSA-Isolaten teil. Klinische Daten wurden mithilfe eines standardisierten Fragebogens erhoben. Die Bestätigung der Methicillin-Resistenz erfolgte mittels mecA- bzw. mecC-Nachweis. Für die insgesamt 1603 Isolate wurden der spa-Typ und das Toxingenprofil bestimmt. Insgesamt dominieren weiter die klassischen HA-MRSA-Typen t003 (40,0%) und t032 (15,5%). Es finden sich jedoch, insbesondere in Schwerpunktregionen, auch wesentliche Anteile von PVL-positiven CA-MRSA (2,7% der Isolate) und der mit MLST ST398 assoziierten LA-MRSA (1,9% deutschlandweit; 40,1% in viehzuchtreichen Gegenden).

Titel: Charakterisierung von nosokomial und ambulant erworbenen Methicillin-resistenten Staphylococcus-aureus-Stämmen aus Deutschland, 2010 - 2011
Weitere Titel Charakterisierung von nosokomial und ambulant erworbenen Methicillin-resistenten Staphylococcus aureus-Stämmen aus Deutschland, 2010 - 2011
Verfasser: Richter, Laura GND
Gutachter: Becker, Karsten
Organisation: FB 05: Medizinische Fakultät
Dokumenttyp: Dissertation/Habilitation
Medientyp: Text
Erscheinungsdatum: 12.05.2014
Publikation in MIAMI: 12.05.2014
Datum der letzten Änderung: 27.07.2015
Schlagwörter: MRSA; LA-MRSA; CA-MRSA; Deutschland; Epidemiologie; MRSA-Population; spa-Typisierung
Fachgebiete: Medizin und Gesundheit
Sprache: Deutsch
Format: PDF-Dokument
URN: urn:nbn:de:hbz:6-23339564521
Permalink: https://nbn-resolving.org/urn:nbn:de:hbz:6-23339564521
Onlinezugriff:
Inhalt:
1 Einleitung ............................................................................................................ 1
1.1 Staphylococcus aureus ..................................................................................... 1
1.2 Virulenzfaktoren ................................................................................................ 2
1.2.1 Porenbildende Toxine .............................................................................. 2
1.2.2 pyrogene Superantigene (SAGs) .............................................................. 2
1.2.3 Exfoliativtoxine ......................................................................................... 3
1.2.4 epidermale Zelldifferenzierungs-Inhibitoren (EDIN) .................................. 3
1.3 Methicillin-resistenter Staphylococcus aureus ................................................... 4
1.3.1 Antibiotika-Resistenz ................................................................................ 4
1.3.2 MRSA ....................................................................................................... 4
1.3.3 hospital-acquired MRSA (HA-MRSA) ....................................................... 5
1.3.4 community-associated MRSA (CA-MRSA) ............................................... 6
1.3.5 livestock-associated MRSA (LA-MRSA) ................................................... 7
1.4 Typisierungsmethoden für MRSA ...................................................................... 9
1.4.1 Pulsfeld Gelelektrophorese ...................................................................... 9
1.4.2 Multilocus Sequenztypisierung ................................................................. 9
1.4.3 spa-Typisierung ...................................................................................... 10
1.4.4 Bestimmung der agr-Subtypen ............................................................... 10
1.5 Arbeitsaufgabe ................................................................................................ 11
2 Material und Methode ............................................................................................. 13
2.1 Studienaufbau ................................................................................................. 13
2.2 Epidemiologische und klinische Datenerhebung .............................................. 13
2.3 Molekulare Charakterisierung .......................................................................... 16
2.4 Nachweis des Protein A-Gens mittels spa-Typisierung .................................... 17
2.4.1 DNA-Isolation ......................................................................................... 17
2.4.2 PCR-Programm zur Amplifikation des spa-Gens .................................... 17
2.4.3 Agarosegelelektrophorese ...................................................................... 19
2.4.4 Aufreinigung des PCR-Produktes mit EXOSAP ...................................... 19
2.4.5 DNA-Sequenzierung .............................................................................. 19
2.5 Multilocus Sequenztypisierung ........................................................................ 20
2.6 Statistik ............................................................................................................ 20
3 Ergebnisse .............................................................................................................. 22
3.1 Demographische Daten ................................................................................... 22
3.1.1 Studienaufbau ........................................................................................ 22
3.1.2 Stationäre und ambulante Versorgung der Patienten ............................. 22
3.1.3 Materialverteilung ................................................................................... 22
3.1.4 Assoziation der MRSA-Isolate mit Infektionen ........................................ 23
3.1.5 Grunderkrankungen der Patienten ......................................................... 24
3.1.6 Anamnestische Risikofaktoren für den nosokomialen MRSA-Erwerb ..... 25
3.1.7 Antibiotikatherapien zur Zeit des MRSA-Nachweises ............................. 27
3.2 Molekulare Ergebnisse .................................................................................... 28
3.2.1 Ergebnisse der spa-Typisierung ............................................................. 28
3.2.2 Regionale Unterschiede in der spa-Typisierung ..................................... 35
3.2.3 Verteilung der spa-Typen nach Risikofaktoren ....................................... 39
3.2.4 Assoziation von spa-Typen mit klinisch relevanten Infektionen ............... 39
3.3 Charakterisierung der MRSA-Exoproteine ....................................................... 40
3.3.1 Vorkommen von Virulenzfaktoren ........................................................... 40
3.3.2 Exotoxingene und Assoziation mit Infektion ............................................ 43
3.4 spa-Typisierung und Virulenzfaktoren.............................................................. 43
3.4.1 Enterotoxingene nach spa-CCs und spa-Typen ..................................... 43
3.4.2 spa-Typen der etd- und edin-B-positiven Isolate..................................... 44
3.4.3 spa-Typen und das Gen für das „toxic shock syndrome“ Toxin (TSST) .. 45
3.5 agr-Subtypen ................................................................................................... 45
3.5.1 Assoziation von spa-Typen mit agr-Subtypen ......................................... 45
3.5.2 Assoziation von Toxingenen mit agr-Subtypen ....................................... 46
3.6 PVL-positive MRSA (CA-MRSA) ..................................................................... 47
3.7 HA-MRSA ........................................................................................................ 51
3.8 LA-MRSA ........................................................................................................ 52
3.8.1 LA-MRSA bei Patienten mit Nutz- und Haustierhaltung .......................... 54
4 Diskussion .............................................................................................................. 55
4.1 Bedeutung und Einordnung der Studie ............................................................ 55
4.2 Epidemiologie .................................................................................................. 56
4.2.1 Demographische Daten .......................................................................... 56
4.2.2 ambulante und stationäre Versorgung der Patienten .............................. 56
4.2.3 MRSA und Assoziation mit Infektionen ................................................... 57
4.2.4 Antibiotikatherapien vor MRSA-Nachweis .............................................. 57
4.3 Molekulare Ergebnisse .................................................................................... 58
4.3.1 mec-Ergebnisse ..................................................................................... 58
4.3.2 Ergebnisse der spa-Typisierung ............................................................. 58
4.3.3 Regionale Häufungen bestimmter spa-Typen ......................................... 59
4.4 Toxingenprofil der MRSA-Stämme .................................................................. 60
4.4.1 Enterotoxingene ..................................................................................... 60
4.4.2 Enterotoxingene und Assoziation mit Infektion ....................................... 61
4.4.3 Weitere Toxingene und Assoziation mit Infektion ................................... 61
4.4.4 Exotoxingene im Zusammenhang mit spa-Typen und agr-Subtypen ...... 62
4.5 CA-MRSA ........................................................................................................ 64
4.5.1 Molekulare Eigenschaften von CA-MRSA .............................................. 65
4.6 HA-MRSA ........................................................................................................ 65
4.7 LA-MRSA ........................................................................................................ 66
4.7.1 geographische Verteilung ....................................................................... 66
4.7.2 epidemiologische und klinische Daten .................................................... 67
4.8 Einschränkungen der Studie ............................................................................ 68
5 Zusammenfassung ................................................................................................. 69
6 Danksagung ............................................................................................................ 71
7 Lebenslauf .............................................................................................................. 73
8 Abkürzungsverzeichnis ......................................................................................... 74
9 Abbildungsverzeichnis .......................................................................................... 77
10 Tabellenverzeichnis ............................................................................................... 79
11 Literaturverzeichnis ............................................................................................... 80............................................................................................... 79
11 Literaturverzeichnis ............................................................................................... 80